¹ Genetic Improvement and Adaptation of Mediterranean and Tropical Plants Research Unit (UMR AGAP), CIRAD, 34398 Montpellier, France
 ² African Center of Excellence in Information and Communication Technologies, University of Yaounde 1, Yaounde, Cameroon
 ³ Department of Plant Biology, Faculty of Science, University of Yaounde 1, PO Box 812, Yaounde, Cameroon
  

Le schéma actuel d’amélioration de l'hévéa démarre par une phase de sélection précoce en champ (3-4 ans) pour identifier les clones les plus productifs, dont le comportement agronomique sera étudié à grande échelle sur une longue période (15-25 ans). On cherche à remplacer le tri phénotypique initial par une sélection génomique (SG). Pour réaliser une première évaluation de la SG, on a utilisé 189 clones de la famille PB260 x RRIM600 (Côte d'Ivoire) génotypés avec 309 SSRs et phénotypés en essai de sélection précoce (croissance et production de latex).

Nous avons déterminé par validation croisée la précision de la SG, en étudiant l’effet de trois facteurs : méthode statistique de prédiction (BL et BRR additifs ou avec dominance, RKHS), taille de la population de calibration et nombre de marqueurs. Nous avons aussi comparé le schéma phénotypique actuel (SEL-P) à deux schémas génomiques : PRESEL-G+SEL-P où l’essai de sélection précoce sert à calibrer un modèle pour présélectionner des plein-frères du croisement initial avant leur évaluation à grande échelle, et SEL-G où les pleins-frères sont directement sélectionnés par SG.

Il n’y a pas de différence significative entre les méthodes statistiques sur la précision de la SG, qui est en moyenne de 0.43 pour la circonférence et 0.57 pour la production de latex, avec 309 SSRs et 162 individus de calibration. En revanche, la précision augmente avec la taille de la population de calibration et le nombre de marqueurs. La précision s’effondre en dessous de 100 SSRs, et plus de marqueurs et d’individus auraient donné des précisions un peu plus élevées. Pour les 2 caractères du croisement considéré, PRESEL-G+SEL-P donne une réponse annuelle à la sélection plus élevée que SEL-P, avec une augmentation supérieure à 10% avec 1500 candidats à la SG. Par contre, SEL-G est moins performant que SEL-P

La SG devrait rendre plus efficace l’amélioration génétique de l’hévéa. Une première mise en œuvre opérationnelle est envisagée.

Contacts : David Cros et André Clément-Demange