Objectifs

Le plateau AFEG de l'UMR Agap Institut offre aux scientifiques l’environnement et les outils pour mener les études permettant d’élucider la fonction des gènes chez les plantes méditerranéennes et tropicales.

De nombreux projets sont accueillis chaque année sur le plateau. La grande majorité d’entre eux vise à déterminer les bases génétiques et fonctionnelles du développement et de l’adaptation des plantes à l’environnement. Les gènes étudiés sur ce plateau interviennent dans le développement, le métabolisme et la réponse aux stress. En effet, ces mécanismes interviennent directement ou indirectement dans la valeur agronomique d’une plante.

Le plateau AFEG permet d'identifier des gènes d'intérêt et/ou de les étudier de manière approfondie grâce à de multiples techniques de biologie moléculaire.

Accueil, encadrement et formation

• Théorique : Cours, travaux dirigés (formation 35h) : « Appliquer la technologie CRISPR-Cas9 en plantes : de la théorie à la pratique »
• Pratique en laboratoire : Technologies d’édition des génomes, biologie moléculaire et biotechnologie

Ateliers

Le plateau est divisé en plusieurs ateliers spécialisés dans :

• Clonage de séquences d’intérêt 
• Transformation de bactéries compétentes 
• Amplification, séparation et quantification d’acides nucléiques 
• Extraction d’ARN, synthèse de cDNA 
• Extraction, visualisation et production de protéines 
• PCR quantitative

Les membres du plateau veillent aux évolutions technologiques et assurent l’accueil et la formation de personnels d’origines diverses (étudiants, techniciens, chercheurs).

Une offre de formation "Appliquer la technologie CRISPR-Cas9 en plantes : de la théorie à la pratique" est proposée sur demande par le plateau AFEG.

Equipements et installations

Ce plateau technique se situe sur le site du Cirad Lavalette. Il est à disposition de toutes les équipes de l’unité et de leurs partenaires.

Il se compose d'équipements classiques de laboratoire ainsi que :

• Appareils de dosage : TapeStation (Agilent) ,Bioanalyser (Agilent), Nanoquant (Tecan),  Fluoroskan Ascent (Thermo Scientific) 
• Thermocycleurs en temps réel : LC480 (Roche) et Biomark (Fluidigm) 
• Thermocycleurs (classique et gradient)
• Hottes chimiques et bactériologiques 
• Electroporateurs (Biorad)