Plateau mycologie

Date de mise à jour : 9 novembre 2022

Ce plateau permet la manipulation et l'étude de champignons compatibles au niveau de confinement L1 (classement des agents biologiques pathogènes).

Objectifs

Ce plateau est au service des études menées sur les espèces fongiques qui sont en interaction avec les espèces de plantes méditerranéennes et tropicales considérées par les équipes de recherche de l'unité Agap et de leurs partenaires. Il accueille également les cultures de levures utilisées comme vecteurs dans les méthodologies d’études moléculaires conduites sur ces plantes.

Le plateau de mycologie est un environnement sécurisé qui permet de mener à bien toutes les étapes de ces études qui impliquent la manipulation d’isolats fongiques vivants.

Savoir-faire, outils et ressources

Le plateau possède des installations, des appareils, ainsi que du matériel pour effectuer un certain nombre de travaux sur les espèces fongiques.

Les différentes activités proposées sont les suivantes :

  • Isolement et identification de souches pour culture pure,
  • Entretien de collections de souches,
  • Détermination d’activité enzymatique,
  • Isolement et contrôles qualitatifs et quantitatifs de l’ADN,
  • Ajustement de conditions PCR de marqueurs spécifiques,
  • Transformation de levure pour création de double hybride.

Pour la réalisation de ces activités, il est mis à disposition 7 postes de travail :

  • Pesées, pH, préparation de solutions et milieux,
  • Manipulations en milieu stérile,
  • Tri d’échantillons et observations microscopiques,
  • Enzymologie,
  • Extraction d’ADN,
  • Mise au point PCR,
  • Doubles hybrides de levure.

Le plateau a, également, une collection d’isolats de diverses espèces fongiques phytopathogènes et lignivores, en culture ou sous forme de sporophores déshydratés. Cette collection est à disposition pour des études sur ces espèces.

Enfin, le plateau est doté d’une expertise sur le modèle fongique basidiomycète Ganoderma boninense. Elle comprend notamment une vaste base de données de génotypes, un génome de référence, des données d’expression, des connaissances sur les traits de vie, et s’appuie sur une large collection d’échantillons en culture ou déshydratés.

Date de mise à jour : 9 novembre 2022