Plateau de Phénotypage Biochimique

Date de mise à jour : 19 juillet 2022

Identifier et analyser des métabolites d’intérêt pour participer à la compréhension du fonctionnement des plantes dans leur environnement et de leurs réponses adaptatives.

Objectifs

Le plateau de biochimie dispose d’un ensemble d’équipements performants et de méthodes d’analyses robustes qui permettent l’identification et l’analyse de métabolites d’intérêt dans le cadre de différents projets de recherche portés par les chercheurs du Cirad et de leurs partenaires.

Il maitrise également la méthodologie de mesures de références pour le développement de modèle de calibration en spectrométrie Proche InfraRouge et permet ainsi de l’analyse à moyen débit.

Savoir-faire, outils et ressources

Le plateau, situé au bâtiment 1 sur le site du Cirad Lavalette, est réparti en différents ateliers :

Un atelier partagé entre différentes équipes du bâtiment 1, dédié aux broyages des échantillons. Ce laboratoire est équipé de plusieurs broyeurs, de technologies différentes permettant de répondre au mieux aux différentes problématiques des végétaux traités (dureté, granulométrie, échantillons fibreux etc) ;

Un atelier dédié à la stabilisation des échantillons, à l’extraction des bio-molécules, ainsi qu’aux différents dosages spectrophotomètriques ;

Un autre atelier utilisé pour réaliser les différentes manipulations techniques (tris, séchage, pesées, extractions etc) nécessaires aux expérimentations. Cet atelier est doté notamment d’une salle de balances équipés de balances de précision différentes (du centième de milligrammes au grammes), d’un système de production d’eau purifiée et d’étuves.

Un atelier analyse chromatographique avec 2 systèmes d’HPLC ;

Un atelier NIRS comprenant plusieurs spectromètres IR et MIR ;

Le dernier atelier est dédié à la chimie des matériaux ligno-cellulosique.

Atelier Broyage

Le plateau est doté de :

  • Broyeurs à couteaux : Retsch ZM200, Kinematica Polymix, Fritsch Pulverisette11, IKA
  • Broyeur à billes : Retsch MM301

D’autres broyeurs de capacité de broyage plus importante sont également disponibles dans cet atelier.

Atelier Stabilisation-extraction-spectrophotométrie

Différents équipements sont disponibles :

  • Lyophilisateur - HETO
  • Evaporateur avec chaleur radiante - Thermo
  • Extracteur automatique Dionex ASE350
  • 3 centrifugeuses de capacités de tubes différentes (du microtube au tube 25mL, microplaque)
  • Un spectrophotomètre lecteur de microplaque -Thermo
  • Un spectrophotomètre monocuve double faisceau – Jasco
  • Un spectrophotomètre multi-cuves – Pharmacia Biotech

Atelier manipulations techniques

Dans ce laboratoire se trouve :

  • Les équipements usuels de laboratoire de biochimie :

pHmètre, plaque chauffante/agitation, bain-marie & bain à sec, système de production d’eau osmosée et purifiée, un lave-vaisselle de verrerie de laboratoire, réfrigérateurs et congélateurs

  • Une salle de balances avec 3 balances de précision différentes
  • De 3 étuves régulées & un four à moufles :
    • Memmert UN75, capacité 75L, température max 300°C
    • MemmertBE400, capacité 40L, température max 70°C
    • Heraeus, capacité 50L, température max 250°C

Atelier HPLC (Chomatographie liquide)

  • Chromatographie Ionique ICS5000 - DIONEX avec détecteurs électrochimiques
  • UHPLC Ultimate3000 – Dionex avec détecteurs UV/barrette de diodes et réfractomètre

Atelier Infra Rouge

  • SPIR
    • Bruker – Tango (800-2500nm)
    • Bonsai – ASD LabSpec4 (350-2500nm)
    • Viavi – MicroNir (900-1600nm)
  • MIR
    • Perkin Elmer – Spectrum two (ATR diamant) (1200-28 500nm)

Atelier Chimie des matériaux ligno-cellulosiques

  • Extractibles
  • Holocellulose et cellulose selon la norme TAPPI
  • Lignine Klason

Date de mise à jour : 19 juillet 2022