EVENTS : Séquences virales endogènes: rôle dans l’évolution des virus et fonctions chez les plantes

Le projet a pour objectif d’élucider le rôle des séquences virales endogènes dans le métabolisme des plantes et de retracer les processus évolutifs des virus de plantes sur des pas de temps inédits.

Date de début de projet

01/01/2018

Date de fin du projet

31/12/2020

Objectifs

  • Création d’outils d’annotation automatique des génomes de plantes pour la recherché se séquences virales endogènes (EVE) Caulimoviridae et Geminiviridae et leur utilisation pour caractériser de nouveaux EVE de plantes
  • Reconstruction de l’histoire évolutive de ces virus à partir des EVE
  • Etude de la contribution des EVE Caulimoviridae et Geminiviridae à la diversité des populations virales
  • Etude de la contribution des EVE caulimovirus et geminivirus au métabolisme des plantes (régulation de l’expression des gènes, résistance antivirale, acquisition de fonctions nouvelles)

Localisation

Guadeloupe, France métropolitaine, Réunion, Afrique du Sud, Australie

Partenaires

CIRAD (UMR AGAP, UMR BGPI, UMR PVBMT), INRA (URGI, UMR BFP), Université du Cap, Université du Cap Occidental, Université du Queensland

Equipe

Génétique et amélioration bananiers et ananas (GABA)

Financement

ANR

Mots-clés

Virus ; plants ; endogenous viral elements ; Caulimoviridae ; Geminiviridae