Structure évolutive des agrumes, polyploïdie et amélioration génétique (SEAPAG)

Contextes et enjeux

Date de mise à jour : 25 octobre 2022

Contextes et enjeux de développement

Originaires d’Asie, les agrumes sont aujourd’hui cultivés dans de nombreuses régions du globe entre les 40emes parallèles Nord et Sud dans le cadre de systèmes de production et de commercialisation très variés. Ces différentes formes d’agrumicultures sont confrontées à des contraintes biotiques (maladies et ravageurs) et abiotiques (sècheresses, salinité des sols) croissantes ainsi qu’à des attentes sociétales fortes en termes de qualités (organoleptiques, nutritionnelles, sécurité sanitaire) et de respect de l’environnement (politique de diminution des intrants, gestion des ressources en eau). Ces contraintes sont en constante évolution du fait de la mondialisation, du changement climatique et des évolutions des habitudes alimentaires en occident et dans les pays émergents. L’innovation variétale peut apporter des réponses à ces enjeux majeurs.

L’équipe SEAPAG développe en partenariat avec des acteurs des secteurs public et privé des projets d’innovation variétale visant à contribuer à la durabilité de l’agrumiculture dans différents bassins de production méditerranéens et tropicaux. Les contextes et enjeux des filières agrumes concernées sont divers (par exemple environnement tropical versus environnement méditerranéen) et renvoient à des objectifs d’amélioration (idéotypes) pouvant eux-mêmes être très différents. La mise en œuvre efficace de ces projets et la diffusion effective de l’innovation auprès des producteurs impliquent, au-delà du périmètre de l’équipe, la mobilisation et l’intégration de compétences dans les domaines de l’analyse socio-économique, de la physiologie de l’adaptation, de la phytopathologie et de la caractérisation de la qualité.

Enjeux scientifiques

Les recherches conduites par l’équipe SEAPAG ont pour objectifs l’acquisition et l’intégration des connaissances dans les domaines de la biologie de la reproduction, de la physiologie de l'adaptation aux stress abiotiques, de la résistance aux maladies et de l'élaboration de la qualité afin d'optimiser l’amélioration génétique des agrumes. Les études de génomique et l’édition du génome permettront in fine de mieux comprendre quels sont les déterminants génétiques et moléculaires à l’origine de la variabilité phénotypique d’intérêt. La multiplication végétative, les origines interspécifiques de la plupart des variétés modernes, l’intérêt de la triploïdie pour créer des variétés sans pépins et de la tétraploïdie des porte-greffes pour une plus grande plasticité vis-à-vis des contraintes biotiques et abiotiques, soulèvent des questions de recherche originales sur les structures phylogénomiques, le fonctionnement des génomes complexes (méiose, expression) et l’élaboration du phénotype. Concernant les méthodologies de création/sélection, la multiplication végétative permet la propagation de tout génotype élite quelle que soit sa structure génomique. Les idéotypes définissant les groupes horticulturaux parmi les plus importants au plan économique (orangers, pomelos, citronniers, limettiers) reposent sur des structures génomiques fortement hétérozygotes, issues de croisements interspécifiques. Leur amélioration est aujourd’hui envisageable via des stratégies de reconstructions phylogénomiques.

Date de mise à jour : 25 octobre 2022