EVENTS : Séquences virales endogènes: rôle dans l’évolution des virus et fonctions chez les plantes
Le projet a pour objectif d’élucider le rôle des séquences virales endogènes dans le métabolisme des plantes et de retracer les processus évolutifs des virus de plantes sur des pas de temps inédits.
Date de début de projet
01/01/2018Date de fin du projet
31/12/2020Objectifs
- Création d’outils d’annotation automatique des génomes de plantes pour la recherché se séquences virales endogènes (EVE) Caulimoviridae et Geminiviridae et leur utilisation pour caractériser de nouveaux EVE de plantes
- Reconstruction de l’histoire évolutive de ces virus à partir des EVE
- Etude de la contribution des EVE Caulimoviridae et Geminiviridae à la diversité des populations virales
- Etude de la contribution des EVE caulimovirus et geminivirus au métabolisme des plantes (régulation de l’expression des gènes, résistance antivirale, acquisition de fonctions nouvelles)
Localisation
Guadeloupe, France métropolitaine, Réunion, Afrique du Sud, Australie
Partenaires
CIRAD (UMR AGAP, UMR BGPI, UMR PVBMT), INRA (URGI, UMR BFP), Université du Cap, Université du Cap Occidental, Université du Queensland
Equipe
Génétique et amélioration bananiers et ananas (GABA)
Financement
ANR
Mots-clés
Virus ; plants ; endogenous viral elements ; Caulimoviridae ; Geminiviridae