SGT : Sorghum Genomics Toolbox (SGT) : TERRA partnership

Le projet SGT a pour objectif d’accélérer l’identification de marqueurs moléculaires d’intérêt pour la sélection variétale du sorgho en Afrique par la mise en œuvre d’un phénotypage haut-débit au champ et le séquençage d’un millier d’accessions de sorgho grain Africains

Date de début de projet

01/01/2017

Date de fin du projet

31/12/2019

Objectifs

Le projet « Sorghum Genomics Toolbox » (SGT) s’inscrit pleinement pour le CIRAD et ses partenaires ouest-africains autour de l’amélioration variétale du sorgho, au sein des enjeux portés par le DP IAVAO. SGT a pour objectif d’accélérer l’identification de traits phénotypiques et de marqueurs moléculaires d’intérêt pour la sélection variétale du sorgho au travers du séquençage du génome et du phénotypage, en champ (Sénégal, Mali, Ethiopie) et en plateforme contrôlée à Montpellier et à l’ ICRISAT en Inde, d’un millier d’accessions de sorghos africains. Pour cela le Danforth Institute (USA), coordinateur du projet et porteur d’une initiative similaire aux Etats-Unis pour le sorgho bioénergie s’est associé au CERAAS, au CIRAD, à l’ICRISAT et à l’IEAR (Ethiopie) afin d’amorcer le développement d’un réseau de stations de phénotypage en Afrique, composante essentielle du DP IAVAO pour la région ouest-africaine. Ce projet sera l’opportunité de développer et valider une démarche innovante associant le phénotypage assisté par l’imagerie aéroportée (drone) de la croissance des plantes en réponse à l’environnement agro-climatique et la gestion et analyse de données massives et hétérogènes issues d’essais multi-locaux.

Localisation

Afrique de l’Ouest

Partenaires

Donald Danforth Plant Science Center et Kansas State University (États-Unis), Icrisat (Inde), Ethiopian Institute of Agricultural Research (Éthiopie), Ceraas (Sénégal), IER (Institut d’économie rurale, Mali)

Equipe

Plasticité phénotypique et adaptation des monocotylédones (PAM)

Financement

Fondation Bill & Melinda Gates, États-Unis (384 k€)

Mots-clés

Sorgho, phénotypage