TheoBRromics : Interaction entre Theobroma grandiflorum et Moniliophthora perniciosa : étude d’association et génomique fonctionnelle
Date de début de projet
01/01/2014Date de fin du projet
31/03/2018Objectifs
L'objectif de ce projet est de produire de l'information sur la génétique du cupuassu (Theobroma grandiflorum, Willd. Ex Spreng.) espèce originaire d’Amazonie, qui appartient à la famille des Malvaceae comme le cacao (Theobroma cacao L.), en particulier sur les mécanismes moléculaires de la résistance au balai de sorcière.
Localisation
Brésil
Description
La partie financée par Agropolis porte essentiellement sur la cartographie génétique et la détection de QTLs de résistance au Balai de sorcière et de QTLs pour d’autres caractères d’intérêt à partir d’une descendance (1074 x 174) de 153 individus, respectivement sensible et résistante à la maladie. Une étude de diversité et de GWAS est également abordée à partir de 146 clones cupuassu issu de la collection du CPATU (Embrapa) de Belém. Le génotypage de l’ensemble des individus est fait par GBS (plateforme Agap/Toulouse).
La partie financée par l’Empraba concerne des actions liées aux approches de génomique fontionnelle (identification de gènes de résistance, validation par qPCR….)
Les résultats (partie Agropolis) seront présentés et valorisés en 2018 (rapport final Agropolis et publications).
Partenaires
Agropolis (Cirad/Ceplac), CAPES et Embrapa.
Equipe
Génome et sélection (GS)
Financement
Fondation Agropolis (28 832 €), Embrapa et CAPES (Brésil)
Mots-clés
Cupuassu, résistance, Balai de sorcière