Offre d'emploi CDD : Ingénieur.e en bioinformatique pour le déploiement d'application web
L'UMR Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales (Agap Institut) recrute un.e ingénieur.e en bio-informatique pour le déploiement d'application web (Genome Hub & Galaxy) pour 18 mois.
En effet, nous avons initié au sein de l'unité le concept de Genome Hubs, un système d'information ayant pour vocation de centraliser un large volume de données génomiques publiques ou privées relatives à une espèce (génomes de référence, larges projets de résequençage) ainsi que différentes données omiques (ex : GWAS, RNAseq, polymorphismes SNP, orthologie, synténie) générées dans le cadre de projets de recherche menés au sein l'unité. Le Genome Hub repose sur le CMS Drupal et le module Tripal qui permet d'interagir avec la base de données Chado, et intègre également un ensemble d'outils bioinformatiques (ex: Blast, JBrowse, Gigwa...) permettant d'exploiter et d'analyser les données hébergées.
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Publiée : 24/10/2022