Chercheur.e en génétique sur l'adaptation et la résistance des agrumes aux stress biotiques, CDI Cirad, UMR Agap Institut, Guadeloupe

Date de mise à jour : 15 janvier 2021

Au sein de l'UMR Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes (AGAP) vous serez affecté.e dans l'équipe ‘Structure Evolutive des Agrumes, Polyploïdie et Amélioration Génétique' (Seapag) qui concentre son action sur l'amélioration des agrumes pour les filières méditerranéennes et tropicales en développant des recherches cognitives et méthodologiques tout au long du processus d'innovation, allant de la génomique à la sélection participative.

Seapag mène depuis six ans, en Guadeloupe, des recherches sur l'adaptation/résistance à la maladie bactérienne du HLB (Huanglongbing). L'équipe a tissé un large réseau partenarial et conduit de nombreux projets régionaux et internationaux sur cette problématique. Cette maladie, la plus dévastatrice pour les agrumicultures des régions tropicales et subtropicales, menace aujourd'hui le Bassin Méditerranéen. La recherche de résistances génétiques s'appuie sur une exploitation large du complexe d'espèce et la manipulation de la ploïdie pour créer des variétés triploïdes aspermes ou cumuler les caractères d'adaptation et de résistances chez des porte-greffes tétraploïdes.
Spécialisé.e dans les approches de génétiques d'association (QTLs, GWAS) et de sélection génomique, vous appliquerez ces compétences à l'étude des déterminants génétiques et moléculaires des résistances et adaptations des agrumes aux stress biotiques (en particulier au HLB) et à l'introgression dans les formes cultivées de gènes de résistance d'espèces apparentées.
Vous aurez pour principales missions :

  • L'adaptation des méthodes de génétique d'association et de sélection génomique à des contextes de polyploïdie et d'inter-spécificité
  • L'analyse des déterminants génétiques et moléculaires des tolérances et résistances au HLB
  • La mise en place d'un schéma d'introgression, assisté par la génomique, des résistances dans les formes cultivées
  • La conduite d'un projet d'amélioration des porte-greffes cumulant les performances agronomiques des porte-greffes traditionnels et la résistance au HLB

L'équipe est associée, dans le pôle de recherche « Structure & Dynamique des Génomes », à plusieurs collectifs partageant, sur d'autres plantes cultivées, des questions de recherches autour de l'interspécificité et de la polyploïdie. Vous travaillerez en étroite collaboration avec les autres chercheurs de ce pôle. De plus, vous participerez, en y portant ces aspects, à l'animation en génétique quantitative et méthodologies de la sélection qui est organisée plus largement dans AGAP. Vous bénéficierez ainsi d'un environnement scientifique propice pour développer vos recherches.

Date de mise à jour : 15 janvier 2021