Plateau de biologie moléculaire en Guadeloupe

Date de mise à jour : 23 mai 2024

Le plateau de biologie moléculaire et de virologie de Neufchâteau de l'UMR Agap Institut offre à la communauté scientifique Guadeloupéenne (unités et partenaires), l’environnement et les outils permettant de faire de la sélection assistée par marqueurs, du contrôle qualité de population, et du diagnostic virologique chez les plantes tropicales et méditerranéennes.

Objectifs

Le plateau de Neufchâteau appuie le programme d’amélioration génétique de l’équipe GABA (Génétique et Amélioration des Bananiers) sur la création et la sélection de nouvelles variétés de bananiers résistant à des maladies émergentes dans la zone Caribéenne, notamment par l’utilisation de techniques de sélection assistée par marqueurs.

Le plateau intègre un programme de contrôle qualité de la collection de bananiers du CRB-PT (Centre de Ressources Biologiques-Plantes Tropicales) et des différentes espèces étudiées telles que l’igname et les agrumes, grâce au développement de marqueurs moléculaires KASPar.

De nombreux projets collaboratifs y sont menés chaque année. Le plateau s’inscrit ainsi dans la surveillance épidémiologique du Banana Streak Virus (BSV) sur le territoire Guadeloupéen et dans le transfert de la technique de diagnostic par IC-PCR du BSV à nos partenaires Caribéens.

Accueil, encadrement et formation

  • Technique de diagnostic virologique par IC-PCR du BSV (Banana Streak Virus).
  • PCR KASPar et utilisation de l’instrument OMEGA.
  • qPCR.

Equipements et installations

Ce plateau technique est à disposition de toutes les équipes et unités présentes sur son site de Neufchâteau, celui de Roujol et des partenaires. La personne référente du plateau veille aux évolutions technologiques et assure l’accueil et la formation des personnes (étudiants, techniciens, chercheurs) dans un cadre QSE. Le plateau se compose des équipements suivants :

  • Appareil de broyage : RETCH format 2x24.
  • Appareil de dosage : Qubit.
  • Appareil de pesée : Balances.
  • Appareils de centrifugation : de paillasse et réfrigérée Sigma.
  • Thermocycleur en temps réel : Applied Biosystems® 7500 fast real-time PCR.
  • Thermocycleurs (classique et gradient) : VeritiPro Thermal Cycler 96.
  • Hotte chimique et bactériologique : Sorbonne.
  • Appareils électrophorèse : Cuve de migration, Imageur Quantum CX5 Egde.
  • Appareils de conservation froid : congélateur -80°C, machine à glace, chambre froide.

Date de mise à jour : 23 mai 2024