Déterminisme génétique de la floraison et du sexe chez l’igname

Date de mise à jour : 22 octobre 2020

Les programmes de sélection conventionnels doivent générer un grand nombre de descendants pour augmenter les chances de sélectionner de nouvelles variétés avec les phénotypes souhaités. Le développement de méthodes de phénotypage et de génotypage à haut débit a nettement amélioré la prédiction des meilleures combinaisons parentales. Cependant, chez l’igname, espèce dioïque, la capacité parentale de croisement (par exemple, fertilité, synchronisation, compatibilité) est un problème majeur. Par conséquent, la connaissance et le contrôle de la biologie de la reproduction végétale sont essentiels pour conduire un programme de sélection efficace.

Une détection de QTL a été conduite sur les descendances des deux populations utilisées pour établir la carte génétique de référence et leurs parents. Les résultats obtenus sur le sex-ratio observé au sein des deux populations, suggèrent qu'un seul locus est impliqué dans la détermination du sexe et est hérité via un système de chromosomes sexuels XX / XY impliquant des mâles hétérogamétiques (XY). Ce QTL a été détecté sur le groupe de liaison LG6 et seulement dans la carte des parents mâles. Le même travail mené sur un panel d’association génétique, a confirmé les résultats obtenus. Une barrière génétique majeure à la reproduction a été identifiée sur le chromosome 1, représentée par deux gènes candidats. Un effet délétère sur la fitness des mâles a très probablement lieu considérant l'implication de ces deux gènes dans la reproduction mâle et la faible fréquence de cet allèle non florifère dominant dans le pool génétique mâle. En outre, nous avons conçu et validé un marqueur KASPar qui permet une identification facile et rapide du sexe des variétés de D. alata.

  • Fabien Cormier, Guillaume Martin, Hélène Vignes, Laurie Lachman, Denis Cornet, Yoana Faure, Erick Maledon, Pierre Mournet, Gemma Arnau, Hâna Chaïr. 2021. Genetic control of flowering in greater yam (Dioscorea alata L). BMC Plant Biology 21 :163 https://doi.org/10.1186/s12870-021-02941-7
  • Cormier Fabien, Lawac Floriane, Maledon Erick, Gravillon Marie-Claire, Nudol Elie, Mournet Pierre, Vignes Hélène, Chaïr Hâna, Arnau Gemma. 2019 A reference high-density genetic map of greater yam (Dioscorea alata L.). Theoretical and Applied Genetics, 132 (6): 1733-1744. https://doi.org/10.1007/s00122-019-03311-6

Date de mise à jour : 22 octobre 2020