L’équipe collabore avec eRcane qui conduit un important programme de création et sélection variétales dédié à une large gamme d’environnements, à La Réunion et dans divers pays de l’Afrique de l’Ouest. A La Réunion, l’analyse du dispositif de sélection multi-locale dans sept environnements représentatifs nous a permis de montrer que :(i) l’interaction génotype x environnement était hautement significative pour le tonnage, les caractères d’usinage de la canne et le rendement sucrier (en termes d’indice économique pour le planteur) et (ii) qu’il n’y avait aucune redondance d’utilité parmi les sites de sélection actuellement utilisés par eRcane. Par ailleurs des analyses (modèles linéaires mixtes) portant sur une décennie d’essais variétaux dans quatre programmes de sélection nous ont permis d’estimer que le progrès génétique annuel concernant l’indice économique (+0.53% à +1.81% selon les sites) n’était statistiquement significatif que dans deux des quatre sites étudiés.

Cette nécessaire multiplicité des programmes de sélection et la relative lenteur des progrès génétiques rend onéreux les programmes d’innovation variétale. Elles motivent le développement de travaux de génétique quantitative génétique utilisant des approches de marquage du génome. La récente disponibilité d’une séquence de référence du génome de la canne à sucre ouvre la voie à la mise au point de systèmes performants de marquage SNP (par capture de séquences) nécessaires au développement d’applications de génomique. Dans le cadre d’une collaboration avec eRcane (projet AGIV), l’équipe s’intéresse à l’étude du déterminisme génétique de caractères de résistance à des maladies (rouille orangée et SCYLV principalement) et à la prédiction génomique de caractères liés au rendement (tonnage de canne, tenue à la repousse, indice économique) et à la qualité d’usinage de la canne (teneur en fibre et en saccharose, pureté des jus).

• Hoarau, J. Y., Dumont, T., Wei, X., Jackson, P., & D’hont, A. (2022). Applications of quantitative genetics and statistical analyses in sugarcane breeding. Sugar Tech, 24(1), 320-340. https://doi.org/10.1007/s12355-021-01012-3
• Dumont, T., Barau, L., Thong-Chane, A., Dijoux, J., Mellin, M., Daugrois, J., & Hoarau, J. Y. (2022). Sugarcane breeding in Reunion: challenges, achievements and future prospects. Sugar Tech, 24(1), 181-192. https://doi.org/10.1007/s12355-021-00998-0
• Dumont T., Thong Chane A., Barau L., Siegmund B., Hoarau J.Y. 2019. Genetic variabilities and genetic gains for yield components in regional sugarcane breeding programmes on Réunion Island. Sugar Tech, 21(6) : 868–878 https://doi.org/10.1007/s12355-019-00718-9
• Guilly S., Dumont T., Thong Chane A., Barau L., Hoarau J.Y. 2017. Analysis of multienvironment trials (MET) in the sugarcane breeding program of Réunion Island. Euphytica, 213 : 213 (20 p.) https://doi.org/10.1007/s10681-017-1994-1