L'architecture du génome des cultivars de canne à sucre modernes et des espèces à leur origine est mal connue. De plus, la diversité génétique et les relations phylogénétiques entre espèces de Saccharum sont encore peu claires ainsi que leur contribution précise aux cultivars actuels. Le genre Saccharum a été divisé en 6 espèces : S. officinarum, S. robustum, S. spontaneum, S. barberi, S. sinense et S. edule, mais cette subdivision a toujours été un sujet de débat.

Pour répondre à ces points, l'équipe a entamé un projet de reséquençage en collaboration avec JGI (Community Science Program, US DOE department) et à travers une collaboration internationale notamment avec des membres de l'ICSB (International Consortium for Sugarcane Biotechnology). Le séquençage du génome de 300 accessions, comprenant des représentants de la diversité de Saccharum et des cultivars clés, sera réalisé.