Développement d'outils génomiques pour la sélection du palmier à huile. Le Consortium OPGP

Présentation par Norbert Billotte, Cirad UMR Agap Institut, équipe GSP - Jeudi 21 septembre 2023

Résumé

Pour satisfaire une demande croissante en huile végétale, il faut beaucoup moins de surfaces de palmier à huile (E. guineensis Jacq.) que n’importe quelle autre culture oléagineuse, tandis que les défis les plus urgents liés directement à l’industrie de l’huile de palme sont de réduire la déforestation et la pression sur la biodiversité naturelle, et d’adopter des pratiques agricoles à faible impact environnemental. Créé en 2008 et coordonné par le Cirad, le consortium international Oil Palm Genome Projects (OPGP), de recherche génomique et génétique du palmier à huile, est une association de quatorze entités privées ou publiques de la filière R&D du palmier à huile. Il représente aujourd’hui ~25% de la superficie totale mondiale cultivée par les petits et grands planteurs du palmier à huile en Asie, en Afrique et en Amérique du Sud.

Nous présentons d’abord les raisons qui ont amené à constituer ce consortium international public-privé et comment nous avons procédé en interne pour le créer (point de départ, démarche, difficultés ou freins rencontrées, quel appui éventuel de la DG Cirad et de l’ex-service Valo ont été nécessaires). Nous expliquons aussi comment nous avons communiqué en direct avec nos partenaires et réussi à les convaincre par cette initiative inédite. Ces informations montrent que d’autres collectifs plante et filières de l’unité pourraient former un consortium de ce type. En termes de recherches, le principal objectif des projets OPGP financés est de développer des outils et des connaissances génomiques en appui à la sélection assistée par marqueurs (SAM) pour l’intensification du rendement et la qualité de l’huile de palme dans des agro-systèmes plus éco-responsables. Nous décrivons la stratégie et les résultats des recherches OPGP menées sur le palmier à huile, ainsi que sur l'espèce sud-américaine apparentée E. oleifera utile en sélection interspécifique. Une énorme quantité d'informations a été générée, notamment des transcriptomes, des cartes génétiques et de QTL de référence, des gènes candidats de caractères agronomiques clés, des séquences de novo ou re-séquencées du génome entier du palmier à huile et d’E. oleifera, des catalogues de marqueurs d’ADN et certaines méthodes précisées pour la SAM de variétés Elaeis intra- ou interspécifiques. Les études réalisées sur la diversité génétique du genre entier Elaeis et des populations de sélection multi-parentales favorisent l’application rapide des résultats OPGP. De plus, un important programme de formation scientifique des projets OPGP facilite le transfert des connaissances et des méthodes aux chercheurs partenaires. La feuille de route du consortium OPGP est en fait un plan à long terme qui prévoit aussi des variétés de palmier à huile totalement nouvelles et dont des sauts de sélection impacteront très largement une filière agro-industrielle de l’huile de palme plus en préservation de la biodiversité et en lutte contre le changement climatique.

Published: 05/01/2024